L’histoire de l’Eglise de Mantes remonte aux débuts de la Réforme au XVIe siècle. Selon la tradition, Calvin prêche dans la région en 1533. Un temple est construit à Avernes en 1563, suivi d’un lieu de culte à Limay en 1565. Parmi les premiers seigneurs huguenots de la région on remarque notamment Philippe du Plessis Mornay (futur conseiller de Henri IV) et Maximilien de Béthune (futur duc de Sully), qui réside au château de Rosny-sur-Seine.

En 1590, la ville de Mantes se rend à Henri IV, alors protestant, qui en fait sa capitale pendant 2 ans. En 1591, le roi promulgue l’édit de Mantes, qui anticipe l’édit de Nantes en établissant des principes de tolérance destinés à mettre un terme aux guerres qui opposèrent protestants et catholiques. En 1593, le roi va pour la dernière fois au prêche protestant à Mantes (18 juillet) . Sa conversion le 25 juillet à Saint Denis lui permettra d’établir sa capitale à Paris.

L’Eglise réformée de Mantes, avec ses deux temples d’Avernes et de Limay, maintient son existence pendant le XVIIe siècle, avec un synode provincial à Mantes en 1621. Cependant, suite à la révocation de l Edit de Nantes en 1685, les deux temples sont détruits.

Pendant le XVIIIe siècle, les quelques protestants survivent clandestinement dans plusieurs endroits notamment à Limay et à Vaux (maintenant Vaux-les-Huguenots, à côté d’Aubergenville). Mais il faut attendre le milieu du XIXe siècle pour voir une vraie renaissance de l’Eglise réformée. On constate de nombreuses conversions, et plusieurs temples (et 3 écoles) sont alors construits : Vaux (1839) Limay, Senneville (1845), Bennecourt (1848), Gommecourt (1864), Monjavoult, Mantes (1866).

L’association cultuelle presbytérale de l’Eglise réformée évangélique de Mantes sur Seine est déclarée en 1906. Après une période difficile dans l’entre-deux-guerres, absence de pasteur et jumelage avec Poissy, la paroisse retrouve son poste pastoral et son autonomie vers 1950. La paroisse est centralisée autour d’un temple agrandi à Mantes.

En 1971, un temple est construit aux Mureaux dans une ancienne dépendance du château de Bècheville.

Plus récemment, de nombreux travaux de rénovation ont été entrepris pour permettre le développement de la paroisse, qui se réjouit depuis plusieurs années d’une croissance significative. Notamment, une modernisation du temple de Mantes (2004) et la création de nouvelles salles de réunion capables d’accueillir les diverses activités de la paroisse (2008).